Iako i MOC i MOF sadrže metalne-organske koordinacijske veze, postoje fundamentalne razlike:
Dimenzionalnost: MOC su 0-dimenzionalni diskretni molekuli, dok su MOF 2D ili 3D beskonačno proširene mreže.
Rastvorljivost: Većina MOC-a je rastvorljiva, dok su MOF-ovi generalno nerastvorljivi.
Stabilnost: MOF-ovi generalno imaju veću termičku stabilnost.
Fokus primjene: MOC-ovi se ističu u molekularnom prepoznavanju, dok su MOF-ovi prikladniji za skladištenje plina.